《生經》卷第四（5）〈毒草侵樹須掘根株・拔除三毒得無量道法寶藏〉
一株大樹原本枝葉茂盛、花果繁美，眾鳥群獸都依止其中；一隻鳥銜來毒草落在樹上，毒氣逐漸侵入，使大樹日漸枯萎。樹神憂苦不知如何自救，天神便教他尋求善權方便之人，把毒根徹底掘除。佛最後親自解明：毒草所喻的是由無明而起的魔事與三毒；真正的修行不能只處理表面的枝葉，而要拔除根本，才能開啟無量道法寶藏。
聞如是。一時佛遊舍衛祇樹給孤獨園。與大比丘眾千二百五十人俱。佛告諸比丘。昔有曠野。其中有大樹。枝葉茂盛。花實繁美。眾鳥依止。群獸遊息。樹下有神。依樹而居。
佛在舍衛祇樹給孤獨園，與一千二百五十位大比丘共住。佛向比丘說起過去曠野中的一株大樹。這株樹枝葉茂盛，花朵與果實繁多美好，許多鳥類依止其上，群獸也在樹下遊行休息；另有樹神依著這株大樹居住。
大樹不只成就自身繁茂，也成為許多生命可以棲息依止之處。樹神與樹相依，因此大樹後來受到毒害，也直接關係到樹神自身的安危。
枝葉茂盛。花實繁美。眾鳥依止。群獸遊息。
一株健全的大樹，能以自己的枝葉花果利益其他生命。後面毒草侵入之後，受害的不只是樹本身，也會使原本依止大樹的眾生失去安穩。
時有飛鳥。銜一毒草。來止樹上。適住未久。毒草墮地。其草毒氣。漸入樹中。大樹日日。枝葉枯悴。花實不生。眾鳥捨去。群獸不止。
有一隻飛鳥銜著一株毒草，飛來停在大樹上。停留不久，毒草便掉落下來。毒氣逐漸侵入樹中，大樹因此一天一天枯萎，枝葉失去生機，也不再開花結果。
原先依止大樹的眾鳥陸續離去，群獸也不再停留。最初只是一株毒草落下，後來卻因毒性深入，逐漸改變整株大樹的狀態。
其草毒氣。漸入樹中。大樹日日。枝葉枯悴。
毒害並非一下便顯出全部結果，而是「漸入樹中」，再使大樹「日日」枯悴。煩惱習氣也常如此：起初只是一念，若反覆容納、隨順，不加照察，便可能漸漸深入，最後影響整個身心。
樹神愁憂。心懷不樂。念言。我樹本甚茂盛。花實繁好。眾鳥依止。群獸遊息。今者何故。枝葉枯悴。花實不生。眾鳥捨去。群獸不止。
樹神看見大樹逐漸衰敗，心中憂愁不樂。他回想這株樹原本枝葉茂盛、花果繁美，眾鳥依止、群獸遊息；如今卻枝葉枯萎、不再結果，鳥獸也全部離去，因此不明白究竟發生了什麼事。
樹神已經看見結果改變，卻還不知道真正原因在哪裡。只知道自己如今不安，還不足以解決問題；必須進一步找到使大樹衰敗的根源。
今者何故。枝葉枯悴。花實不生。眾鳥捨去。群獸不止。
修行也常從這個疑問開始：為什麼自己的心越來越不安？為什麼原有的善念減少？為什麼與人的關係不再和順？若只對結果難過，而不追究貪瞋癡如何進入心中，問題仍會繼續存在。
時有天神。住在虛空。見樹神愁憂。問言。何故不樂。樹神具以事答。天神告曰。卿樹上有毒草。墮在根邊。毒氣入樹。故令枯悴。欲令樹復。當拔毒草。掘其根本。勿使遺餘。
這時有一位天神住在虛空中，看見樹神憂愁，便詢問原因。樹神把事情完整說出。天神告訴他，大樹之所以枯萎，是因為有毒草落在樹根旁，毒氣已經侵入樹中。
若想使大樹恢復，就必須把毒草拔除，而且要掘出它的根本，不能留下殘餘。若只除去看得見的部分，毒根仍在，毒害仍有再次生起的可能。
當拔毒草。掘其根本。勿使遺餘。
真正的關鍵不只是把表面毒草割掉，而是「掘其根本」。煩惱若只在外在行為上暫時壓住，內心貪著、瞋恨、愚癡的根仍未處理，遇到相應境界時仍可能再次生起。
樹神報曰。我不能自拔。天神告曰。當求人來。使拔去之。樹神曰。誰能拔者。天神曰。有一善人。智慧方便。當從此過。卿可求之。樹下有金。藏在地中。可以與之。令除毒草。
樹神回答，自己沒有能力把毒草拔除。天神便教他尋求人來幫助。樹神再問誰有能力完成此事，天神說，不久會有一位善人從此經過，此人具有智慧與方便，可以請他相助。
樹下地中還藏有黃金，可以取出交給善人，請他徹底除去毒草。問題既已找到根源，接著便需要具足智慧方便的人，以適當的方法真正處理。
有一善人。智慧方便。
知道自己無力處理，不必因此停住。能夠尋求有智慧、有方法的人幫助，也是離苦的重要一步。後面佛把虛空天神與善權方便的引導轉入正法修行，顯示除煩惱不能只靠盲目用力，還要有正確的方法。
未久之間。其人來至。樹神即現。具以事告。願見救濟。拔此毒草。樹下有金。當以相與。其人即掘。拔去毒草。根本都盡。得其金寶。大樹漸復。枝葉還茂。花實復生。眾鳥還集。群獸復止。
不久，那位善人果然來到。樹神現身，把大樹受毒的情形完整告訴他，請求他救助，拔除毒草，並答應把樹下所藏的黃金交給他。
善人隨即動手挖掘，把毒草連根拔除，使根本完全除盡，也得到所藏的金寶。毒根除去之後，大樹並非瞬間恢復，而是漸漸復原；枝葉重新茂盛，花果再次生長，眾鳥重新聚集，群獸也回來停留。
拔去毒草。根本都盡。
前面天神說「掘其根本，勿使遺餘」，善人真正做到「根本都盡」。從知道原因到真正拔除，中間還需要實際行動。懂得煩惱有害，與真正修到使煩惱根本漸除，仍有一段必須親自走過的路。
大樹漸復。枝葉還茂。花實復生。眾鳥還集。群獸復止。
毒根除後，大樹是「漸復」，並非立刻恢復。修心也是如此。長久形成的習氣即使開始對治，也需要時間使善法重新增長；不應因修了幾日仍有煩惱，就認為修行沒有作用。
佛告諸比丘。欲知爾時曠野者。三界是也。其大樹者。菩薩身是。樹神者。發意菩薩是。毒草者。魔事是也。飛鳥銜草者。無明所致。毒氣入樹者。婬怒癡是。
佛開始逐一解明譬喻。那片曠野，所指的是三界；大樹，對應菩薩之身；依樹而居的樹神，是已經發心的菩薩；使大樹受害的毒草，所指的是魔事；飛鳥銜來毒草，是由無明所致；毒氣侵入樹中，則對應婬、怒、癡三毒。
如此便能看見毒害的次第：無明使毒草來到，魔事得以侵入，三毒再深入身心，使原有善法漸漸衰損。
飛鳥銜草者。無明所致。毒氣入樹者。婬怒癡是。
貪欲、瞋怒、愚癡並不是孤立發生。無明使人不能如實看清，於是容易讓染污進入；三毒一旦深入，又使身口意繼續受其影響。若只處理最後顯出的惡行，而不照見無明與三毒，仍未真正掘到根處。
天神者。如來是也。善人者。善權方便是。掘毒草者。除三毒也。根本都盡者。得不起法忍也。地下金者。道法藏也。枝葉還茂者。總持門也。花實復生者。六度無極三十七品四等四恩十力無畏十八不共諸佛之法也。眾鳥還集群獸復止者。開化一切諸天人民。使發無上正真道意也。
佛繼續解明：虛空中指示樹神的天神，所指的是如來；能夠處理毒草的善人，是善權方便；挖掘毒草，就是除去三毒；毒草根本完全除盡，對應得到不起法忍；地下所藏的黃金，是道法之藏。
大樹重新枝葉茂盛，對應總持門；花果重新生長，則對應六度無極、三十七品、四等、四恩、十力、無畏、十八不共諸佛之法。最後眾鳥重新聚集、群獸再次停留，所指的是開化一切諸天人民，使眾生發起無上正真道意。
掘毒草者。除三毒也。根本都盡者。得不起法忍也。地下金者。道法藏也。
前面的拔草不再只是外在故事，而是直接落到除三毒。毒根除盡，才顯出更深的法忍與道法寶藏。原先以為修行只是失去貪瞋癡，實際上當染污漸除，顯出的卻是廣大道法資糧。
花實復生者。六度無極三十七品四等四恩十力無畏十八不共諸佛之法也。
大樹恢復後不只是自己存活，又重新開花結果。除三毒也不是修行的終點；布施、持戒、忍辱、精進、禪定、智慧，以及三十七品、四等、四恩，乃至佛的十力、無畏與不共法，都是善法重新茂盛所顯出的廣大方向。
開化一切諸天人民。使發無上正真道意也。
大樹恢復後，眾鳥群獸重新得到依止；菩薩清淨修行之後，也不是只求自己遠離三毒，而要進一步教化眾生，使諸天人民都發起無上正真道心。自淨其心與利益眾生，在此相連而不分離。
《今日修行觀照》
很多煩惱一開始都像落在樹旁的一株小毒草，看起來並不嚴重。
一點貪念、一念瞋心、一個不願面對的執著，如果反覆隨順，便可能「漸入樹中」。等到情緒、言語、關係與生活都受到影響時，才發現根已經很深。
修行不是等枝葉全枯才救，而是在毒氣剛開始進入時，就願意看見、願意處理。
更重要的是「掘其根本，勿使遺餘」。只忍住一次脾氣，還要看瞋從哪裡來；只暫時離開欲境，還要看心為何如此貪著。能不斷向內照見根源，對治才不只是表面。
《慧照心得》
毒草最初很小，真正危險的是讓毒氣一直深入。
修行也是如此。煩惱剛起時若能照見，容易轉離；若一再隨順，最後便可能使善法枯萎。佛所指的不是只把枝葉修好，而是「除三毒」，直到根本漸盡。
學僧 釋慧照 頂禮十方一切諸佛 南無本師釋迦牟尼佛 南無西方阿彌陀佛 感恩諸尊共修法親 阿彌陀佛 阿彌陀佛 阿彌陀佛